Юго-западная часть переулка в первой половине XVII века называлась Владимирская, или Садовническая улица, что было связано с её расположением в местности Сады, или Старые Сады, по которым назван соседний Старосадский переулок, и близостью церкви Князя Владимира, что в Старых Садах. С XVII века употребляется название Хохловский переулок по местности Хохлы или Хохловка, в которой селились украинцы; возникновение этого названия, по-видимому, связано с близостью к Маросейке, где в то время находилось Малороссийское (Украинское) подворье.
Примечательный объекты:
По нечётной стороне:
№ 3 — Доходный дом (1900-е, арх. Б. Н. Шнауберт). В настоящее время в доме размещается Диспетчерская № 1
№ 5/14 — Городская усадьба Венедиктовых — Шнаубертов — Б. Ш. Моносзона (нач. XX в., архитектор С. С. Эйбушиц)
№ 7 — Палаты Украинцева. В настоящее время здесь располагаются НТЦ "Ректор", дом культуры "Оригинал";
№ 13, строение 1 — Городская усадьба И. В. Четверикова — доходное владение М. Г. Кувшинова (1899, архитектор Ф. Ф. Воскресенский), сейчас — американский совет по международным исследованиям и обменам "Айрекс";
По чётной стороне:
№ 2/6 (Подкопаевский пер., д. 6/2, стр. 1) Главный дом усадьбы М. В. Челнокова, 1837, 1856 (выявленный Объект культурного наследия)
№ 10, строение 1 — Главный дом городской усадьбы (1-я половина XIX в., архитектор Е. Д. Тюрин), сейчас — генеральная дирекция Московского международного кинофестиваля "Интерфест";
№ 12 — Церковь Троицы Живоначальной в Хохлах
№ 5/14, стр.1 (Подкопаевский пер., д.14/5) Городская усадьба Венедиктовых — Шнаубертов — Б. Ш. Моносзона, 1-я пол. XVIII в. — нач. XX в., архитектор С. С. Эйбушитц, Объект культурного наследия
№ 18, строение 1 — СФ Интерстрой.
№ 20/6 — Доходный дом Медынцевых (1867, архитектор В. Н. Карнеев)